По общему правилу судебные инстанции соглашаются с ревизорами в случаях, когда отсутствие положения о внутреннем контроле в составе документов, регламентирующих учетную политику, квалифицируется в качестве нарушения. Однако само по себе наличие такого локального акта вовсе не свидетельствует о достаточной организации системы внутреннего контроля в учреждении, поскольку качество такого контроля подтверждается отсутствием нарушений в деятельности учреждения в принципе. В настоящее время порядок осуществления внутреннего контроля не стандартизирован. Несмотря на то, что такой порядок организациями бюджетной сферы должен устанавливаться с учетом положений бюджетного законодательства РФ. Разработать и утвердить такой порядок учреждение должно самостоятельно с учетом своей организационной структуры и отраслевой специфики деятельности – какого-то универсального решения в разработке такого порядка быть не может.